KRT31

KRT31

A gene on chromosome 17q21.2 that encodes a type-I keratin, an intermediate filament protein that heterodimerises with type-II keratins to form hair and nails.
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Se estudiaron 31 genes de queratina reportados para ovinos, cabras y humanos entre los cuales tenemos 12 genes del epitelio de tipo I (KRT9, KRT10, KRT12, KRT13, KRT14, KRT15, KRT16, KRT17, KRT18, KRT19, KRT20 y KRT25), 13 genes del epitelio de tipo II (KRT1, KRT2, KRT3, KRT4, KRT5, KRT6a, KRT6b, KRT6c, KRT7, KRT8, KRT71, KRT79 y KRT80), 3 genes de la fibra de tipo I (KRT31, KRT32 y KRT40) y 3 genes de la fibra de tipo II (KRT81, KRT82 y KRT83) (Zhidong et al.
Se identificaron un total de 48 PNSs de los cuales 14 PNSs se encuentran distribuidos en 8 genes de queratina de epitelio de tipo I (KRT9, KRT12, KRT13, KRT14, KRT16, KRT18, KRT20, KRT25); 23 PNSs distribuidos en los 8 genes de queratina de epitelio de tipo II (KRT1, KRT3, KRT5, KRT6a, KRT7, KRT8, KRT71, KRT80); 4 PNSs en los genes de queratina de fibra de tipo I (KRT31, KRT32, KIRT40) y 7 PNSs en los genes de queratina de fibra de tipo II (KRT81, KRT82, KRT83).
El analisis comparativo de secuencias genicas entre las cuatro especies estudiadas, indico que los genes KRT25, KRT10, KRT12, KRT20, KRT40, KRT31, KRT32, KRT13, KRT15, KRT19, KRT9, KRT14, KRT16 y KRT17 estan ubicados en el cromosoma 17, 11 y 19 de humano, ovino y cabra respectivamente; y en alpaca se encuentran en el scaffold 188 y 450 (Fig.
En el scaffold 450, los posibles PNSs de los genes KRT31, KRT32, KRT13, KRT9, KRT14y KRT16 formaron dos haplotipos, el 5'CTGAAG3' y el 5'TCAGGA3'.
(2018) identifico PNSs en los genes KRT27, KRT31, KRT36, KRT38, KRT81 y KRT85 y encontro que el gen KRT31 esta significativamente asociado al diametro de lana, por ello, seria importante utilizar los dos PNSs reportados en este estudio para el gen KRT31 de la alpaca, porque tambien podrian estar asociados con el diametro de fibra.
Los 31 genes de queratina utilizados para este trabajo fueron ubicados en su totalidad en humanos, los genes KRT6b, KRT6c, KRT31, KRT81 y KRT83 no estan presentes y/o anotados para ovino y cabra en sus genomas referenciales en el NCBI y los genes KRT6a, KRT6b, KRT6c y KRT81 no estan presentes y/o anotados en el Vicpac 2.0.2.
The wool follicle genes as KRT31, KRT33a, KRT35, KRT38, KRT81, KRT83, KRT85, and KRT86 expressed in sheep keratin gene reported by [14-17].
The main objective of this study was to analyze the possible polymorphisms in 17 primer fragments of six candidate genes of the keratin family, including KRT27 (exons 3 and 8, introns 2 and 5), KRT31 (intron 2), KRT36 (exons 1, 2, and 3), KRT38 (exon 3, introns 2 and 7), KRT81 (exons 1 and 2, introns 1 and 3), KRT85 (exon 3, intron 2) in CMXT using the polymerase chain reaction-based single-strand conformation polymorphism (PCR-SSCP) and DNA sequencing methods.
On the basis of the sequences of the KRT27, KRT31, KRT36, KRT38, KRT81, and KRT85 genes obtained from the National Center for Biotechnology Information GenBank database (GenBank accession numbers AC_000176[521074], AC_ 000176[539597], AC_000176[520668], NC_00176[515000], AC_000162[540204], AC_000162[528459], respectively), 17 pairs of PCR primers (P1-P17, Table 1) were designed to amplify different PCR products including exon3, exon8, intervening sequence 2 (IVS2), IVS5 of KRT27; IVS2 of KRT31; exon2, exon3 of KRT36; exon3, exon7, IVS2 of KRT38; exon1, exon2, IVS1, IVS3 of KRT81; and exon3, IVS2 of KRT85.
In this study, PCR-SSCP and DNA sequencing methods were used to identify polymorphisms in the sheep KRT27, KRT31, KRT36, KRT38, KRT81, and KRT85 genes.
In the P5 fragment of KRT31 gene, two unique SSCP genotypes were observed (named AA and AB, Figure 1A).
Association of the KRT31, KRT36, KRT38, and KRT85 genes polymorphisms with wool traits in CMXT sheep